Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM89A2RUT3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms