Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYCE3A1L190 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYCE3A1L190 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms