Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBA6A0AVT1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms