Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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