Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ABLIM1-206ENST00000392952 6841 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
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COL4A6Q14031 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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COL4A6Q14031 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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