Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 RETREG1-202ENST00000399793 3145 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 KIT-201ENST00000288135 5186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 PRDM10-201ENST00000304538 5817 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 ATG13-201ENST00000359513 4348 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 KIZ-AS1-203ENST00000616177 5370 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 STAU1-210ENST00000614381 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 LRIG3-202ENST00000379141 3667 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 KRTAP3-4P-201ENST00000430780 280 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 RN7SL870P-201ENST00000460111 296 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC010605.1-201ENST00000597303 797 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AL513548.2-201ENST00000602994 1207 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 ASH1L-201ENST00000368346 11942 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 C11orf88-203ENST00000529167 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 SLC11A2-203ENST00000394904 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 PRICKLE2-205ENST00000638394 9956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 CORIN-202ENST00000502252 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 KIAA1671-202ENST00000401395 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 LDB3-201ENST00000263066 3873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 PSMD6-AS2-201ENST00000472046 2456 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 ZNF107-204ENST00000423627 5773 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 FMN2-206ENST00000543681 2902 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 LCT-201ENST00000264162 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 ZNF235-201ENST00000291182 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 ADGRE1-201ENST00000250572 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 GIP-201ENST00000357424 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AF274855.1-201ENST00000411474 850 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 DPP10-AS1-202ENST00000448663 644 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC096743.1-201ENST00000485172 319 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC021820.1-201ENST00000525564 808 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 RPSAP68-201ENST00000625020 438 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 TRPM3-210ENST00000377111 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 KALRN-201ENST00000240874 6537 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 KALRN-211ENST00000460856 6509 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 OR2M4-202ENST00000641868 5934 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 ZIM3-201ENST00000269834 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 PSG6-201ENST00000187910 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 CAST-228ENST00000509903 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 TFDP2-224ENST00000499676 9335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 RPL5P8-201ENST00000396820 815 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 RBBP4P4-201ENST00000398588 1289 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 AP005329.3-201ENST00000609924 686 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 CDY7P-201ENST00000429883 1604 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 ZNF626-203ENST00000601440 5963 ntTSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 VWDE-206ENST00000614403 4701 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 PCDHB1-201ENST00000306549 8210 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 FAM114A1-201ENST00000358869 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SPHKAPQ2M3C7 DDX10-203ENST00000526794 6707 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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