Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AL024493.1-201ENST00000449217 833 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 IGHVIII-26-1-201ENST00000520387 250 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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PTPRMP28827 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AL355306.2-203ENST00000635102 1025 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AC124319.2-201ENST00000575034 3651 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 UNC5C-201ENST00000453304 9875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 LINC00663-203ENST00000586885 2546 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 RAPGEF5-212ENST00000620335 5506 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 FKBP14-201ENST00000222803 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 PLEC-206ENST00000357649 14689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AC090643.1-201ENST00000623600 3100 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 FBXO11-202ENST00000403359 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 ANKS1B-215ENST00000549493 3328 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 SIPA1L2-201ENST00000262861 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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PTPRMP28827 SLC14A1-221ENST00000619403 3823 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AC127459.1-201ENST00000563129 2768 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 CRNKL1-202ENST00000377340 4406 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 MUC6-201ENST00000421673 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 ATG13-207ENST00000526508 4199 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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PTPRMP28827 RPL34-202ENST00000394667 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 LINC01393-202ENST00000435981 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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PTPRMP28827 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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PTPRMP28827 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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PTPRMP28827 AC011933.4-201ENST00000585081 403 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AC011374.1-201ENST00000564471 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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PTPRMP28827 SLC38A2-201ENST00000256689 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 DARS2-201ENST00000361951 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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PTPRMP28827 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 CNTN4-201ENST00000397459 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AC018992.1-201ENST00000523778 2149 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 RND3-202ENST00000375734 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 NPR3-202ENST00000326958 6380 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AMBRA1-206ENST00000528950 4102 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 POF1B-202ENST00000373145 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 PDE4DIP-219ENST00000524974 8305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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PTPRMP28827 MSANTD3-206ENST00000613183 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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PTPRMP28827 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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PTPRMP28827 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 ALB-203ENST00000415165 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 CNTRL-212ENST00000613863 2418 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 CDH23-203ENST00000398788 4329 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 ST13P6-201ENST00000522430 1102 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 SSX2B-202ENST00000596480 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 MIR663AHG-237ENST00000615682 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 CRNDE-214ENST00000637011 865 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 ZC3H11A-203ENST00000367212 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 IFT88-201ENST00000319980 3091 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 ANK3-205ENST00000373827 7202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 CASK-204ENST00000378166 3123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 MAPK8-201ENST00000360332 5438 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 TCF20-202ENST00000359486 7410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 ZNF776-201ENST00000317178 5292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PTPRMP28827 BCL2L13-203ENST00000355028 4458 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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