Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 IGHV4-59-201ENST00000390629 495 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AL445430.2-201ENST00000423149 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 PEG10-208ENST00000615790 6394 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 MIAT_exon5_1.1-201ENST00000618919 149 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 C5orf56-207ENST00000621237 486 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 ADAM3A-205ENST00000481351 2379 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 SERPINB8-203ENST00000397985 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 DPYSL2-201ENST00000311151 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 SLC16A1-AS1-204ENST00000428411 8757 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 TMEM135-202ENST00000340353 3938 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 ARHGEF9-201ENST00000253401 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 FCGR3A-201ENST00000367967 2086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 COL4A6-210ENST00000621266 6627 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 GDNF-208ENST00000620847 3638 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 TSC22D1-213ENST00000622051 2872 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 NELL1-201ENST00000298925 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 LCORL-207ENST00000635767 10430 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 PTPRM-203ENST00000400060 5030 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 LINC01630-201ENST00000435144 5489 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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PTPRMP28827 NASP-203ENST00000372052 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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PTPRMP28827 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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PTPRMP28827 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 SOX6-211ENST00000528429 2656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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PTPRMP28827 ORM1-201ENST00000259396 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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PTPRMP28827 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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PTPRMP28827 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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PTPRMP28827 NEDD1-201ENST00000266742 4046 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 ACKR2-201ENST00000422265 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 CCDC30-202ENST00000342022 3098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 EFHC1-233ENST00000637353 3829 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AL390856.1-201ENST00000412174 628 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 IGKV1OR2-2-201ENST00000451163 355 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 LINC01706-201ENST00000455299 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AC013787.1-201ENST00000460165 307 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 DUSP22-216ENST00000605863 551 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 OAZ3-211ENST00000639906 708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AL355103.1-201ENST00000557246 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 PPARGC1A-206ENST00000507380 2385 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AC104051.2-201ENST00000518934 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 RAPGEF6-215ENST00000627212 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AC130365.1-201ENST00000530524 1553 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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