Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms