Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms