Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP20Q9Y2K6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms