Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FARSAQ9Y285 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms