Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HDAC5Q9UQL6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms