Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMC3Q9UQE7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC3Q9UQE7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms