Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNMA8BQ9ULN7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNMA8BQ9ULN7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNMA8BQ9ULN7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNMA8BQ9ULN7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNMA8BQ9ULN7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNMA8BQ9ULN7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNMA8BQ9ULN7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNMA8BQ9ULN7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNMA8BQ9ULN7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNMA8BQ9ULN7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNMA8BQ9ULN7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNMA8BQ9ULN7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNMA8BQ9ULN7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNMA8BQ9ULN7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNMA8BQ9ULN7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNMA8BQ9ULN7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PNMA8BQ9ULN7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNMA8BQ9ULN7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNMA8BQ9ULN7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNMA8BQ9ULN7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNMA8BQ9ULN7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNMA8BQ9ULN7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNMA8BQ9ULN7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PNMA8BQ9ULN7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PNMA8BQ9ULN7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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