Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PUF60Q9UHX1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PUF60Q9UHX1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms