Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms