Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UPB1Q9UBR1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms