Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUCLA2Q9P2R7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCLA2Q9P2R7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms