Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms