Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC88CQ9P219 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC88CQ9P219 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms