Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP5Q9NZZ3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP5Q9NZZ3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms