Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NKIRAS2Q9NYR9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NKIRAS2Q9NYR9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms