Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSD3Q9NYI0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSD3Q9NYI0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms