Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms