Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTMR4Q9NYA4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTMR4Q9NYA4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms