Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC6A13Q9NSD5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC6A13Q9NSD5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms