Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C8orf4Q9NR00 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C8orf4Q9NR00 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms