Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms