Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CYP4F12Q9HCS2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYP4F12Q9HCS2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms