Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CBX8Q9HC52 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CBX8Q9HC52 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms