Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1DQ9H5J8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1DQ9H5J8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms