Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC90BQ9GZT6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms