Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE2OQ9C0C9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms