Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM5Q9C035 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms