Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NLRP1Q9C000 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP1Q9C000 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms