Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRNKL1Q9BZJ0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CRNKL1Q9BZJ0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CRNKL1Q9BZJ0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CRNKL1Q9BZJ0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CRNKL1Q9BZJ0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CRNKL1Q9BZJ0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRNKL1Q9BZJ0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRNKL1Q9BZJ0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRNKL1Q9BZJ0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRNKL1Q9BZJ0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRNKL1Q9BZJ0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRNKL1Q9BZJ0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRNKL1Q9BZJ0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CRNKL1Q9BZJ0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRNKL1Q9BZJ0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CRNKL1Q9BZJ0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CRNKL1Q9BZJ0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRNKL1Q9BZJ0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRNKL1Q9BZJ0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRNKL1Q9BZJ0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRNKL1Q9BZJ0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRNKL1Q9BZJ0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRNKL1Q9BZJ0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRNKL1Q9BZJ0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRNKL1Q9BZJ0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRNKL1Q9BZJ0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRNKL1Q9BZJ0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms