Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SETD2Q9BYW2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SETD2Q9BYW2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SETD2Q9BYW2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SETD2Q9BYW2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SETD2Q9BYW2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SETD2Q9BYW2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms