Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SRRTQ9BXP5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRRTQ9BXP5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms