Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUP58Q9BVL2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms