Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC32Q9BV29 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC32Q9BV29 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms