Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
THUMPD2Q9BTF0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms