Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALS2Q96Q42 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ALS2Q96Q42 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALS2Q96Q42 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms