Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf85Q96MD7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms