Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP53Q96M91 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP53Q96M91 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms