Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP47Q96K76 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP47Q96K76 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms