Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MS4A4AQ96JQ5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A4AQ96JQ5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms