Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRIG1Q96JA1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms