Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRP36Q96EU6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms