Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHFRQ96EP1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHFRQ96EP1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms